1959年，中共阿里分工委成立农、水工作站。1960年3月1日，成立阿里专署农牧科。1961年6月16日，成立中共阿里分工委农牧工作部。1964年8月5日，阿里专署农牧科改为农牧局。1965年6月24日，中共阿里分工委农牧工作部改为农牧政治部。1968年10月，阿里地区革命委员会生产指挥组下设农牧组。1974年6月，恢复农牧局。1980年8月，成立农牧局党组，农牧局下设办公室、畜牧科、农林科、水电科4个职能科（室），辖畜牧兽医总站、农机公司、种畜场、普兰县检疫站4个企事业单位。1987年4月，农牧局更名为畜牧局。1992年4月，畜牧局更名为农牧局，下设办公室、畜牧科、农林科、土地管理科、农牧业项目管理科5个职能科（室），辖畜牧兽医总站、种畜场、草原站3个事业单位及农机公司（企业）。1993年3月5日，在地区农牧局内设林业公安科、水利科。1998年7月，水利科从农牧局分设。1998年2月，成立阿里地区林业局，归属农牧局，为正科级事业单位，与林业公安派出所实行一个机构、两块牌子。1998年7月6日，林业公安科更名为林业公安分局。2019年4月21日，农牧局撤销并成立农业农村局。2024年6月25日，根据机构改革工作统一部署，不在保留单设的地区乡村振兴局，地区乡村振兴局职责划入地区农业农村局，加挂乡村振兴局牌子。